在城市的不起眼角落，经营着名叫樱屋的粗点心小店。小店上一代的主人已经去世，如今店主的孙子太郎（小田切让 饰）继承了这里。虽然这只是家月营业额仅三万元左右小店，但太郎仍尽心和奶奶（八千草薰 饰）守护着这里，守护他们一成不变平凡的生活。三十多岁形同废柴的太郎，日常最爱干的就 是和啃老损友三枝（胜地凉

　　在静冈县三岛市，分别矗立着三所高中，分别是名校骏豆西高中、吊车尾云集的驹形大学附属三岛高中和全女子教会学校圣三岛女子学院。因当年礼拜堂火灾引发的事件，比邻而居的东高和三女互相仇视，不可调和。债台高筑的三女面临破产的命运，于是关于三女和佛教的东高合并的传言甚嚣尘上。在东高任教的原平助（锦户亮 饰）

　　喧嚣繁忙的国际大都会东京，红男绿女匆匆行走，为了理想、爱情、生计全速奔忙，不曾停下脚步。直到午夜十二点，他们才拖着疲惫的身体和步伐，来到了那间营业时间从深夜到次日一早的深夜食堂，品味永远和善寡言的老板（小林薰 饰）亲手烹制出来的美食。这些人中有过气的歌手、丧失创意的新人漫画家、对人性绝望的侦探、

　　五台山以著名的佛教圣地扬名海内外，终日晨钟暮鼓，梵音缭绕，由于日寇的疯狂侵略，使这原本清净的佛教圣地不再清净。在五台山清平庵中，以杨排凤(李彩桦饰)为代表的一批尼姑，在民族存亡的关键时刻，组建了一支女兵排，凭借各自特长，做出了“出家不忘爱国，入世灭日寇，惩恶即扬善”的正义抉择。而由张卫健扮演的女

　　当红一时的传奇编辑，被业界有实力的漫画出版社邀请，委以总编之职，以求复兴。然而，不久他就堕楼身亡，现场没有遗书，事件也看似没有疑点，警察最后以自杀来认定。但是，关于他的死，仍旧疑点重重，编辑部人员也议论纷纷。“是他杀？还是自杀？”，对此抱有怀疑、如今负责出版相关事宜的调查员水野优希(松下奈绪)，

　　午夜12点，在繁华都市的一个小角落，一家食堂才刚刚开始营业。这家深夜食堂的老板(小林薰 饰)虽然脸上带着伤疤，却是一个温情且厨艺精湛的男人。虽然小店里的菜谱很简单，但是只要是客人想吃的都可以点，所以小店备受底层小市民的喜爱。延续第一季的风格，深夜食堂里每晚都上演一个耐人寻味的故事，每个故事的主角

　　午夜12点，报时钟响起，城市的一隅，属于一家食堂的时间开始了。菜谱只有猪肉套餐，但你想吃的都可以点。这就是老板（小林薰 饰）的经营方针。特殊的风格和怀念的味道，招来了不少的客人。大家喝着小酒，吃着自己钟情的食物，卸下一天的疲惫，谈论着遇到的趣事，或是独自品味忧愁。在食物的香气里，在深夜特有的幽静

　　2004年的圣诞夜，某高级公寓内，野口贵弘（德井义实 饰）及其妻子奈央子（小西真奈美 饰）双双遇害，现场则有四个惊慌失措的年轻人：杉下希美（荣仓奈奈 饰）、成濑慎司（窪田正孝 饰）、安藤望（贺来贤人 饰）和西崎真人（小出惠介 饰）。最后西崎认罪，入狱服刑十年。曾经在濑户内海某小岛担任驻警的退休刑

　　警视厅搜查一课青年刑警石川安吾（小栗旬 饰）是一个内心倍感空虚和孤独的人，当初做巡警时他曾在现场附近抓住凶手，从而如愿进入刑警队伍。这一人生转折令他平日里隐隐期盼案件的发生。然而这一次当他照例巡查现场附近时，却被神秘之人开枪击中头部，幸运的是石川最终从死亡线上活转过来。 某晚，一家三口被人残忍杀

　　东京地检城西支部，川尻健三郎（松重丰 饰）、田村雅史（杉本哲太 饰）、马场礼子（吉田羊 饰）、宇野大介（滨田岳 饰）等性格各异的检察官插科打诨，玩笑斗嘴，日复一日过着波澜不惊的公务员生活。美貌动人而踌躇满志的麻木千佳（北川景子 饰）这天从上司处得知，她将为某位新来的检察官担任事务官，谁知来者正是